X-Men üyeleri yeryüzünün, hatta uzayın farklı uçlarında yaşam mücadelesi verirken, New York şehri ise neredeyse yok edilmiştir. X-Men üssünün büyük bölümü yerle bir edilmiş ve Profesör Xavier tekrar sakat bırakılmıştır. Magneto ise Manhattan'ın en uzun Gökdeleninin tepesinde, adını Yeni Genosha koyduğu şehre hükmetme ve Dünya'nın manyetik kutuplarının yerlerini değiştirerek, yeryüzündeki tüm insanları öldürüp yeni bir Mutant çağı başlatma amacındadır.