San Francisco Polisi'nden Dedektif Rebecca Madsen'ın bir cinayet mahallinden aldığı parmak izi, ilginç bir şeyi ortaya çıkarır. Parmak izinin sahibi Jack Slyvanne'nin 50 yıl önce Alcatraz'da ölmüş olması gerekmektedir. Buna benzer başka olaylar da gerçekleşmekte olay Madsen'ın ilgisini çeker.
Hükümet ajanı Emerson Hauser araştırmasını sabote etmeye kalktığındaysa iş inada biner. Madsen, Alcatraz uzmanı ve çizgi roman hastası Dr.Diego Soto'yla işbirliği yaparak Slyvanne'nin peşine düşer. Sonuçta da kendisini bulurlar...
Slyvanne sadece canlı değildir, Alcatraz'da geçirdiği günlerden bu yana hiç yaşlanmamıştır. Çaresiz Ajan Hauser ve asistanı Lucy Banerjee'yle güçbirliği yapan Madsen ve Soto, hükümetin örtbas ettiği ilginç olayları ortaya çıkarır. Buna göre Alcatraz'daki herkes günün birinde hiçbir iz bırakmadan kaybolmuştur.
Hükmet olayın üzerini tüm mahkumların başka yere nakledildiğini söyleyerek örtmüş, Alcatraz'ı da kapatmıştır. Bugünse mahkumlar ve gardiyanlar yeniden belirmeye başlamıştır. Dedektif Rebecca Madsen, bu esrarengiz olayın temelinde yatan sebebi araştırırken, kendisi ve ailesiyle ilgili bilmediği şeyler de öğrenecektir.
