Dünyanın değişik yerlerindeki parlak bilimadamları gizemli şekillerde ortadan kaybolmaktadırlar. Bu arada devasa robotlar New York sokaklarını cehenneme çevirmiştir. Bu garip olayları araştırmak üzere Chronicle muhabiri Polly Perkins görevlendirilir. Polly, eski aşkı Sky Captain olarak bilinen pilot Joseph Sullivan ile birlikte araştırmaya başlar.
Çeşitli tehlikeli tuzaklar sonucunda, tüm olayların arkasında çılgın bilimadamı Dr. Totenkopf'un olduğunu tespit eden ikili, güzel komutan Franky Cook'un da yardımıyla dünyayı bu çılgın adamın ve robotlarının elinden kurtarmaya çalışacaktır.
