Im Mittelpunkt steht Commander Helena Cain, die nach dem Fall der Zwölf Kolonien mit harter Hand das Überleben ihres Schiffes sichert. Die Pegasus verfolgt dabei eine deutlich brutalere Strategie als die Battlestar Galactica: Sie opfert Zivilisten, setzt auf rücksichtslose Militäraktionen und verliert dabei zunehmend moralische Grenzen.
Die Geschichte zeigt, wie Cain und ihre Crew unter extremem Druck Entscheidungen treffen, die sie zwar am Leben halten, aber ihre Menschlichkeit kosten – und bereitet so die spätere, spannungsgeladene Begegnung mit der Galactica vor.
